Anti-CTCF ウサギモノクローナル抗体（WB, IF/ICC, IP, ELISA, ChIP, ChIP-seq, CUT&Tag対応） - P49711

主要製品仕様およびパラメータ

生物学的背景：CTCFの機能と局在

• CTCF（CCCTC結合因子または11ジンクフィンガータンパク質としても知られる）は、配列特異的なDNA部位に結合し、ループ形成やDNAの核構造への固定化を通じてクロマチンの3D構造を調節するクロマチン結合因子です。 関連参考文献： PMID:16949368, PMID:18347100, PMID:18654629
• クロマチンインシュレーターに結合することで、活性なDNAとヘテロクロマチンDNAの境界を定義し、プロモーターと近傍のエンハンサーおよびサイレンサーとの相互作用を阻止することで、長距離遺伝子サイレンシングを媒介します。 関連参考文献： PMID:18347100, PMID:18654629, PMID:19322193
• CTCFは、ゲノムインプリンティングIGF2/H19座におけるアレル特異的遺伝子発現に関与し、高次クロマチン構造を媒介し、母親由来アレルにおけるIGF2へのエンハンサーアクセスを制限します。 関連参考文献： PMID:16107875, PMID:16815976, PMID:17827499
• 調節可能なエピジェネティックスイッチを確立し、エスケープ遺伝子における安定なメチル化の伝播を防ぐことで、X染色体不活化において重要な役割を果たします。 関連参考文献： PMID:11743158
• CTCFは主に核に局在し、中期においてセントロメアや染色体腕と会合します。ここでは、コヘシンの局在および姉妹染色分体接着に必要です。 関連参考文献： PMID:18550811, PMID:26321640
• MYCおよびBAG1の転写リプレッサーとして、またAPPの転写アクチベーターとして作用し、その二重の調節機能を示します。 関連参考文献： PMID:8649389, PMID:9591631, PMID:9407128
• このタンパク質には、アセチル化、リン酸化、およびSUMO化（イソペプチド結合）を含む複数の翻訳後修飾部位が含まれており、これらはクロマチン結合および転写活性を調節します。
• CTCFはヒト組織に広く発現していますが、一次精母細胞には顕著に存在しないことから、組織特異的な調節役割が示唆されます。

実験のガイダンスと技術的なヒント

• 免疫原は、ヒトCTCFのC末端領域のアミノ酸628～727にまたがっており、これはジンクフィンガーDNA結合領域とは異なるドメインです。これにより、他のジンクフィンガータンパク質よりも内因性CTCFに対する抗体特異性が高まることが期待されます。
• ウェスタンブロットでは、約83 kDaのバンドが予測されます。実際の移動度は、翻訳後修飾やゲル条件により異なる場合があるため、既知のポジティブコントロールで検証してください。
• クロマチン免疫沈降（ChIP）およびChIP-seqの場合は、細胞種に応じて架橋およびクロマチン断片化条件を最適化してください。濃縮を評価するために、ポジティブ（例：H19 ICR）およびネガティブコントロールのゲノム領域を含めてください。
• 免疫蛍光法を行う際は、強固な核染色を確実にするために、固定および透過処理プロトコルを実験的にテストする必要があります。核およびセントロメアへの細胞内局在が観察される場合があります。
• この抗体はCUT&Tagに適しており、ChIP-seqよりも少ない細胞数で効率的な代替手段を提供します。最適な結果を得るために、酵素タグ付け条件および抗体濃度の検証をお勧めします。

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